你妹妹午餐吃什么？

因为楼主没有说明他问的是什么时间什么状态，所以做了两个翻译。

你妹妹午餐通常吃什么？这是一般时态，询问经常性和习惯性的动作或状态。

你妹妹午餐吃了什么？(这是讲过去的一个动作。)